System do elektroforezy składa się z dwóch głównych elementów: zasilacza i komory do elektroforezy. Zasilacz dostarcza energię. „Moc” w tym przypadku to elektryczność. Energia elektryczna pochodząca z zasilacza przepływa w jednym kierunku, z jednego końca komory elektroforetycznej na drugi. Katoda i anoda komory przyciągają przeciwnie naładowane cząstki.
Wewnątrz komory do elektroforezy znajduje się taca, a dokładniej taca do odlewania. Taca odlewnicza składa się z następujących części: płyta szklana, która wchodzi na dno tacy odlewniczej. Żel jest trzymany na tacy do odlewania. „Grzebień” wygląda jak jego nazwa. Grzebień umieszcza się w szczelinach z boku tacy do odlewania. Umieszcza się go w szczelinach PRZED wylaniem gorącego, roztopionego żelu. Po zestaleniu żelu grzebień jest wyjmowany. „Zęby” grzebienia pozostawiają w żelu małe dziury, które nazywamy „studzienkami”. Studzienki powstają, gdy gorący, stopiony żel zestala się wokół zębów grzebienia. Grzebień wyciąga się po ostygnięciu żelu, pozostawiając zagłębienia. Dołki zapewniają miejsce do umieszczenia cząstek, które chcesz przetestować. Osoba musi zachować szczególną ostrożność, aby nie uszkodzić żelu podczas ładowania cząstek. Pęknięcie lub pęknięcie żelu prawdopodobnie wpłynie na wyniki.